Nhận thức tầm quan trọng của ứng dụng CNTT trong việc khám, chữa bệnh nhằm cải cách thủ tục hành chính trong quá trình thanh toán BHYT giữa cơ quan bảo hiểm xã hội (BHXH) và bệnh viện mà còn đảm bảo công khai, minh bạch trong lĩnh vực BHYT, những năm qua Bệnh viện đã chủ động đầu tư, nâng cấp hạ tầng CNTT hệ thống mạng Internet kết nối bằng đường truyền cáp quang tốc độ cao;  hầu hết cán bộ nhân viên trong bệnh viện đã được trang bị máy tính phục vụ công việc.

Bệnh viện đã thực hiện kết nối dữ liệu với phần mềm hệ thống thông tin giám định BHYT và cổng tiếp nhận hồ sơ đề nghị thanh toán BHYT. Hệ thống giám định cung cấp các chức năng hỗ trợ các cơ sở y tế tra cứu thông tin thẻ BHYT, cập nhật thông tin thay đổi đối với các trường hợp gia hạn thẻ, thay đổi quyền lợi theo các quy định mới hoặc đủ điều kiện miễn cùng chi trả…giúp người bệnh được bảo đảm đầy đủ quyền lợi khám, chữa bệnh khi đang điều trị tại bệnh viện và giảm đáng kể thời gian chờ khám, chữa bệnh của người dân.

Bên cạnh đó, hệ thống giúp nâng cao hiệu quả quản lý quỹ khám, chữa bệnh BHYT, phát hiện kịp thời những bất thường trong thanh toán chi phí khám, chữa bệnh BHYT, đảm bảo quyền lợi cho người tham gia.

Mặc dù số lượng bệnh nhân tới khám chữa bệnh khá đông, nhưng mọi thủ tục hành chính đều được cán bộ bệnh viện giải quyết nhanh chóng nhờ sử dụng phần mềm quản lý bệnh viện, các dữ liệu thông tin về bệnh nhân được nhập một lần tại phòng khám và sử dụng theo dây truyền cho tất cả các nghiệp vụ, giúp đội ngũ cán bộ y bác sỹ bệnh viện giải quyết thủ tục hành chính nhan gọn, chính xác. Bệnh nhân đến khám sẽ được lưu thông tin hành chính, mã thể BHYT, các đơn khám lần trước, được gọi tên qua hệ thống số tự động; kết quả khám chữa bệnh được kết xuất từ hệ thống máy móc tới phần mềm ứng dụng chuyển tới các khoa, phòng giúp bác sỹ, y tá thuận lợi trong việc kiểm soát điều trị cho bệnh nhân, kết quả khám chữa bệnh minh bạch rõ ràng…

Không chỉ giúp bệnh nhân giảm thời gian chờ đợi, việc ứng dụng phần mềm còn giúp cán bộ y bác sỹ bệnh viện tiết kiệm được thời gian, công sức, có điều kiện tập trung làm công tác chuyên môn, nâng cao chất lượng khám chữa bệnh. Đồng thời giúp ban lãnh đạo quản lý được tần suất sử dụng máy móc, trang thiết bị của các khoa phòng. Ngoài ra bệnh viện sử dụng mạng nội bộ và internet thông qua HIS để thông tuyến với cổng giám định Bảo hiểm xã hội giúp việc thực hiện bảo hiểm xã hội đúng quy định, tránh tiêu cực phát sinh

Với những cố gắng nỗ lực của cán bộ, nhân viên, năm 2018, Bệnh viện Đa khoa khu vực Phúc Yên hoàn thành và hoàn thành vượt mức các chỉ tiêu so với kế hoạch được giao so với cùng kỳ năm 2017. Bệnh viện đã khám bệnh cho gần 168 nghìn lượt người, vượt hơn 27% so với kế hoạch giao; điều trị nội trú cho gần 50 nghìn lượt người, vượt hơn 100% kế hoạch giao; số ngày điều trị trung bình cho một người bệnh giảm còn 6,1 ngày; công suất sử dụng giường bệnh đạt 166,4%kế hoạch. Trong năm, bệnh viện đã thực hiện 19 kỹ thuật mới với 596 ca, trong đó, phẫu thuật nội soi cắt tử cung hoàn toàn 42 ca; phẫu thuật nội soi dây chằng chéo trước 5 ca; phẫu thuật lấy máu tụ dưới màng cứng mạn tính một bên 2 ca; phẫu thuật lấy máu tụ dưới màng cấp tính 2 ca; phẫu thuật cố định cột sống bằng vít qua cuống 5 ca...

Để phát huy những thành quả đã đạt được thực hiện tốt nhiệm vụ chăm sóc, bảo vệ sức khỏe nhân dân trong thời gian tới, Đảng ủy, Ban Giám đốc Bệnh viện Đa khoa khu vực Phúc Yên tiếp tục lãnh đạo, chỉ đạo đơn vị tập trung đầu tư cơ sở vật chất, trang thiết bị khám, chữa bệnh hiện đại; tăng cường triển khai các kỹ thuật mới; xây dựng, đào tạo nguồn nhân lực có trình độ chuyên môn cao, chuyên sâu; cải cách hành chính, nâng cao chất lượng phục vụ, hướng tới bệnh viện thông minh đáp ứng nhu cầu phát triển của con người và xã hội, nhất là trong thời đại Cách mạng công nghiệp 4.0, từ đó nâng cao chất lượng khám chữa bệnh hướng tới sự hài lòng của người bệnh.